Protein–RNA interactions for Protein: P34932

HSPA4, Heat shock 70 kDa protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA4P34932 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.01■■■□□ 2.08
HSPA4P34932 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSPA4P34932 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
HSPA4P34932 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms