Protein–RNA interactions for Protein: P32418

SLC8A1, Sodium/calcium exchanger 1, humanhuman

Predictions only

Length 973 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC8A1P32418 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLC8A1P32418 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SLC8A1P32418 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SLC8A1P32418 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms