Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
HOXC13P31276 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
HOXC13P31276 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HOXC13P31276 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms