Protein–RNA interactions for Protein: P30408

TM4SF1, Transmembrane 4 L6 family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF1P30408 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
TM4SF1P30408 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
TM4SF1P30408 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
TM4SF1P30408 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
TM4SF1P30408 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms