Protein–RNA interactions for Protein: P30260

CDC27, Cell division cycle protein 27 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC27P30260 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC27P30260 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
CDC27P30260 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC27P30260 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC27P30260 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC27P30260 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC27P30260 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC27P30260 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CDC27P30260 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC27P30260 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC27P30260 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC27P30260 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CDC27P30260 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDC27P30260 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CDC27P30260 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC27P30260 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC27P30260 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC27P30260 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC27P30260 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC27P30260 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC27P30260 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CDC27P30260 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC27P30260 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC27P30260 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC27P30260 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC27P30260 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC27P30260 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CDC27P30260 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC27P30260 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC27P30260 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC27P30260 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC27P30260 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC27P30260 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC27P30260 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CDC27P30260 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC27P30260 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC27P30260 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC27P30260 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC27P30260 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC27P30260 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC27P30260 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC27P30260 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CDC27P30260 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC27P30260 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC27P30260 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC27P30260 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC27P30260 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC27P30260 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC27P30260 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC27P30260 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CDC27P30260 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC27P30260 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
CDC27P30260 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
CDC27P30260 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC27P30260 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC27P30260 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC27P30260 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC27P30260 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC27P30260 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC27P30260 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC27P30260 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CDC27P30260 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC27P30260 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC27P30260 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC27P30260 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC27P30260 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC27P30260 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC27P30260 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC27P30260 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC27P30260 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CDC27P30260 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC27P30260 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC27P30260 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC27P30260 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC27P30260 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC27P30260 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC27P30260 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC27P30260 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC27P30260 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CDC27P30260 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC27P30260 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC27P30260 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC27P30260 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC27P30260 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC27P30260 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC27P30260 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC27P30260 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CDC27P30260 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC27P30260 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC27P30260 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CDC27P30260 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC27P30260 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC27P30260 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC27P30260 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC27P30260 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
CDC27P30260 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC27P30260 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC27P30260 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC27P30260 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CDC27P30260 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.7 ms