Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ATP5DP30049 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ATP5DP30049 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ATP5DP30049 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms