Protein–RNA interactions for Protein: P29536

LMOD1, Leiomodin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD1P29536 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
LMOD1P29536 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
LMOD1P29536 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
LMOD1P29536 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms