Protein–RNA interactions for Protein: P26441

CNTF, Ciliary neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFP26441 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTFP26441 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CNTFP26441 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTFP26441 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTFP26441 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTFP26441 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTFP26441 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTFP26441 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CNTFP26441 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTFP26441 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTFP26441 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTFP26441 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTFP26441 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTFP26441 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTFP26441 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTFP26441 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTFP26441 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CNTFP26441 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTFP26441 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTFP26441 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CNTFP26441 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTFP26441 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTFP26441 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTFP26441 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTFP26441 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CNTFP26441 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTFP26441 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTFP26441 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTFP26441 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CNTFP26441 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTFP26441 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTFP26441 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTFP26441 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CNTFP26441 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTFP26441 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTFP26441 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTFP26441 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTFP26441 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTFP26441 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTFP26441 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CNTFP26441 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTFP26441 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTFP26441 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTFP26441 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTFP26441 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTFP26441 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTFP26441 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTFP26441 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTFP26441 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTFP26441 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTFP26441 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTFP26441 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CNTFP26441 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CNTFP26441 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTFP26441 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTFP26441 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTFP26441 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTFP26441 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTFP26441 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CNTFP26441 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTFP26441 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTFP26441 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTFP26441 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTFP26441 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTFP26441 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTFP26441 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTFP26441 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CNTFP26441 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CNTFP26441 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CNTFP26441 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTFP26441 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTFP26441 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTFP26441 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTFP26441 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CNTFP26441 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms