Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMLP26374 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMLP26374 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMLP26374 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CHMLP26374 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMLP26374 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMLP26374 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMLP26374 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMLP26374 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CHMLP26374 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMLP26374 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMLP26374 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMLP26374 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMLP26374 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMLP26374 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMLP26374 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMLP26374 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
CHMLP26374 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMLP26374 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMLP26374 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMLP26374 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMLP26374 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMLP26374 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMLP26374 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMLP26374 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
CHMLP26374 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMLP26374 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CHMLP26374 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
CHMLP26374 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMLP26374 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMLP26374 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CHMLP26374 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMLP26374 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMLP26374 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMLP26374 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMLP26374 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMLP26374 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMLP26374 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CHMLP26374 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMLP26374 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMLP26374 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMLP26374 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMLP26374 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMLP26374 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CHMLP26374 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMLP26374 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMLP26374 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMLP26374 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMLP26374 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMLP26374 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CHMLP26374 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CHMLP26374 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMLP26374 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMLP26374 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMLP26374 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMLP26374 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMLP26374 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMLP26374 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CHMLP26374 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMLP26374 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMLP26374 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMLP26374 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMLP26374 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMLP26374 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMLP26374 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CHMLP26374 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CHMLP26374 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMLP26374 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMLP26374 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMLP26374 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMLP26374 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMLP26374 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CHMLP26374 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMLP26374 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMLP26374 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMLP26374 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms