Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
NFKBIAP25963 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NFKBIAP25963 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NFKBIAP25963 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms