Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
PTAFRP25105 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
PTAFRP25105 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PTAFRP25105 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms