Protein–RNA interactions for Protein: P24043

LAMA2, Laminin subunit alpha-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA2P24043 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LAMA2P24043 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LAMA2P24043 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LAMA2P24043 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms