Protein–RNA interactions for Protein: P23109

AMPD1, AMP deaminase 1, humanhuman

Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMPD1P23109 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
AMPD1P23109 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
AMPD1P23109 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
AMPD1P23109 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms