Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL1P22362 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL1P22362 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL1P22362 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL1P22362 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
CCL1P22362 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCL1P22362 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCL1P22362 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCL1P22362 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
CCL1P22362 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL1P22362 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL1P22362 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL1P22362 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL1P22362 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL1P22362 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL1P22362 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL1P22362 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CCL1P22362 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL1P22362 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL1P22362 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL1P22362 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL1P22362 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL1P22362 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CCL1P22362 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL1P22362 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL1P22362 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL1P22362 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL1P22362 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL1P22362 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL1P22362 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL1P22362 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL1P22362 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CCL1P22362 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL1P22362 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL1P22362 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL1P22362 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL1P22362 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL1P22362 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL1P22362 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL1P22362 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CCL1P22362 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CCL1P22362 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CCL1P22362 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCL1P22362 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
CCL1P22362 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL1P22362 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL1P22362 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL1P22362 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL1P22362 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL1P22362 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL1P22362 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL1P22362 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL1P22362 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CCL1P22362 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
CCL1P22362 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL1P22362 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL1P22362 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL1P22362 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL1P22362 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL1P22362 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL1P22362 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL1P22362 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
CCL1P22362 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL1P22362 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL1P22362 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL1P22362 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL1P22362 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL1P22362 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL1P22362 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL1P22362 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
CCL1P22362 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms