Protein–RNA interactions for Protein: P20908

COL5A1, Collagen alpha-1(V) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1P20908 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
COL5A1P20908 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
COL5A1P20908 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
COL5A1P20908 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL5A1P20908 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL5A1P20908 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL5A1P20908 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL5A1P20908 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL5A1P20908 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
COL5A1P20908 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL5A1P20908 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL5A1P20908 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
COL5A1P20908 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms