Protein–RNA interactions for Protein: P20336

RAB3A, Ras-related protein Rab-3A, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3AP20336 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
RAB3AP20336 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
RAB3AP20336 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
RAB3AP20336 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms