Protein–RNA interactions for Protein: P20138

CD33, Myeloid cell surface antigen CD33, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD33P20138 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CD33P20138 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD33P20138 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
CD33P20138 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD33P20138 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD33P20138 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD33P20138 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD33P20138 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD33P20138 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CD33P20138 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD33P20138 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD33P20138 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CD33P20138 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD33P20138 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD33P20138 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD33P20138 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CD33P20138 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD33P20138 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD33P20138 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CD33P20138 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CD33P20138 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CD33P20138 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD33P20138 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD33P20138 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD33P20138 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD33P20138 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CD33P20138 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CD33P20138 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD33P20138 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD33P20138 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD33P20138 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD33P20138 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD33P20138 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD33P20138 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD33P20138 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CD33P20138 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CD33P20138 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD33P20138 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD33P20138 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CD33P20138 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CD33P20138 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CD33P20138 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms