Protein–RNA interactions for Protein: P19397

CD53, Leukocyte surface antigen CD53, humanhuman

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD53P19397 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD53P19397 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD53P19397 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CD53P19397 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD53P19397 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD53P19397 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD53P19397 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD53P19397 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
CD53P19397 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD53P19397 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD53P19397 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD53P19397 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CD53P19397 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD53P19397 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD53P19397 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD53P19397 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD53P19397 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CD53P19397 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD53P19397 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD53P19397 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD53P19397 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CD53P19397 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CD53P19397 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD53P19397 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD53P19397 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD53P19397 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CD53P19397 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD53P19397 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD53P19397 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
CD53P19397 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD53P19397 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CD53P19397 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CD53P19397 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD53P19397 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD53P19397 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD53P19397 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD53P19397 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD53P19397 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CD53P19397 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD53P19397 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CD53P19397 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD53P19397 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD53P19397 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD53P19397 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD53P19397 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD53P19397 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD53P19397 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD53P19397 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CD53P19397 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD53P19397 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD53P19397 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD53P19397 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD53P19397 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD53P19397 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD53P19397 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CD53P19397 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD53P19397 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD53P19397 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD53P19397 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD53P19397 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD53P19397 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD53P19397 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD53P19397 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CD53P19397 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CD53P19397 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CD53P19397 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms