Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT15P19012 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT15P19012 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT15P19012 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT15P19012 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT15P19012 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
KRT15P19012 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT15P19012 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT15P19012 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT15P19012 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT15P19012 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT15P19012 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
KRT15P19012 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
KRT15P19012 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT15P19012 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT15P19012 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT15P19012 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT15P19012 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
KRT15P19012 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT15P19012 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT15P19012 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
KRT15P19012 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT15P19012 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT15P19012 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT15P19012 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT15P19012 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT15P19012 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT15P19012 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
KRT15P19012 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
KRT15P19012 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT15P19012 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT15P19012 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT15P19012 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT15P19012 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT15P19012 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT15P19012 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT15P19012 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
KRT15P19012 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT15P19012 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT15P19012 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
KRT15P19012 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT15P19012 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT15P19012 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT15P19012 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT15P19012 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
KRT15P19012 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT15P19012 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT15P19012 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT15P19012 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT15P19012 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT15P19012 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT15P19012 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT15P19012 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT15P19012 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
KRT15P19012 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT15P19012 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT15P19012 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT15P19012 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT15P19012 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT15P19012 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT15P19012 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
KRT15P19012 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
KRT15P19012 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT15P19012 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT15P19012 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT15P19012 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT15P19012 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT15P19012 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
KRT15P19012 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT15P19012 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT15P19012 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT15P19012 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT15P19012 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT15P19012 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT15P19012 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
KRT15P19012 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT15P19012 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT15P19012 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT15P19012 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
KRT15P19012 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
KRT15P19012 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms