Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF6P18850 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF6P18850 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF6P18850 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF6P18850 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATF6P18850 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF6P18850 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF6P18850 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF6P18850 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF6P18850 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF6P18850 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATF6P18850 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF6P18850 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF6P18850 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF6P18850 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF6P18850 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATF6P18850 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF6P18850 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF6P18850 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF6P18850 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF6P18850 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATF6P18850 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF6P18850 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF6P18850 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF6P18850 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF6P18850 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF6P18850 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF6P18850 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF6P18850 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATF6P18850 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6P18850 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6P18850 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6P18850 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6P18850 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6P18850 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6P18850 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6P18850 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATF6P18850 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF6P18850 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF6P18850 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF6P18850 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATF6P18850 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATF6P18850 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF6P18850 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF6P18850 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATF6P18850 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF6P18850 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF6P18850 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF6P18850 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF6P18850 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF6P18850 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATF6P18850 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6P18850 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6P18850 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6P18850 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6P18850 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6P18850 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6P18850 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6P18850 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6P18850 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATF6P18850 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF6P18850 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATF6P18850 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF6P18850 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATF6P18850 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6P18850 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6P18850 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6P18850 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6P18850 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6P18850 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6P18850 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6P18850 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6P18850 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ATF6P18850 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF6P18850 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ATF6P18850 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATF6P18850 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATF6P18850 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ATF6P18850 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF6P18850 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF6P18850 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF6P18850 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF6P18850 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF6P18850 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF6P18850 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ATF6P18850 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF6P18850 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF6P18850 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF6P18850 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF6P18850 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF6P18850 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF6P18850 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF6P18850 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ATF6P18850 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ATF6P18850 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF6P18850 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF6P18850 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF6P18850 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF6P18850 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ATF6P18850 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 221.8 ms