Protein–RNA interactions for Protein: P18428

LBP, Lipopolysaccharide-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBPP18428 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
LBPP18428 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LBPP18428 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
LBPP18428 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
LBPP18428 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBPP18428 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
LBPP18428 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBPP18428 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
LBPP18428 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBPP18428 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
LBPP18428 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBPP18428 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
LBPP18428 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBPP18428 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBPP18428 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LBPP18428 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
LBPP18428 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBPP18428 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBPP18428 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBPP18428 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
LBPP18428 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBPP18428 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBPP18428 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBPP18428 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBPP18428 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBPP18428 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBPP18428 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
LBPP18428 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LBPP18428 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
LBPP18428 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LBPP18428 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
LBPP18428 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LBPP18428 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
LBPP18428 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
LBPP18428 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LBPP18428 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
LBPP18428 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LBPP18428 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
LBPP18428 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
LBPP18428 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LBPP18428 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LBPP18428 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LBPP18428 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LBPP18428 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LBPP18428 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
LBPP18428 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
LBPP18428 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
LBPP18428 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
LBPP18428 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LBPP18428 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LBPP18428 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LBPP18428 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LBPP18428 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LBPP18428 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
LBPP18428 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LBPP18428 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LBPP18428 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
LBPP18428 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LBPP18428 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
LBPP18428 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LBPP18428 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LBPP18428 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
LBPP18428 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
LBPP18428 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms