Protein–RNA interactions for Protein: P18074

ERCC2, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPD subunit, humanhuman

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC2P18074 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
ERCC2P18074 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ERCC2P18074 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ERCC2P18074 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.3 ms