Protein–RNA interactions for Protein: P17948

FLT1, Vascular endothelial growth factor receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FLT1P17948 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FLT1P17948 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
FLT1P17948 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
FLT1P17948 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FLT1P17948 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
FLT1P17948 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
FLT1P17948 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
FLT1P17948 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
FLT1P17948 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
FLT1P17948 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLT1P17948 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLT1P17948 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLT1P17948 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLT1P17948 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLT1P17948 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
FLT1P17948 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
FLT1P17948 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLT1P17948 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLT1P17948 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLT1P17948 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLT1P17948 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLT1P17948 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
FLT1P17948 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
FLT1P17948 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FLT1P17948 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FLT1P17948 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FLT1P17948 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
FLT1P17948 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
FLT1P17948 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
FLT1P17948 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
FLT1P17948 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
FLT1P17948 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
FLT1P17948 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLT1P17948 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLT1P17948 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLT1P17948 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLT1P17948 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLT1P17948 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLT1P17948 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FLT1P17948 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLT1P17948 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLT1P17948 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLT1P17948 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLT1P17948 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLT1P17948 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLT1P17948 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FLT1P17948 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FLT1P17948 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FLT1P17948 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FLT1P17948 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FLT1P17948 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FLT1P17948 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FLT1P17948 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FLT1P17948 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FLT1P17948 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FLT1P17948 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FLT1P17948 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FLT1P17948 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FLT1P17948 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FLT1P17948 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FLT1P17948 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT1P17948 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT1P17948 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT1P17948 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT1P17948 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT1P17948 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FLT1P17948 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT1P17948 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT1P17948 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT1P17948 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT1P17948 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FLT1P17948 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT1P17948 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT1P17948 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT1P17948 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT1P17948 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT1P17948 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
FLT1P17948 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT1P17948 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT1P17948 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT1P17948 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
FLT1P17948 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
FLT1P17948 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FLT1P17948 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT1P17948 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT1P17948 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
FLT1P17948 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT1P17948 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT1P17948 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT1P17948 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FLT1P17948 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms