Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
DESP17661 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DESP17661 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
DESP17661 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DESP17661 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DESP17661 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
DESP17661 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
DESP17661 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DESP17661 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DESP17661 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
DESP17661 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
DESP17661 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DESP17661 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DESP17661 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
DESP17661 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DESP17661 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DESP17661 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
DESP17661 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DESP17661 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DESP17661 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DESP17661 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DESP17661 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DESP17661 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DESP17661 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
DESP17661 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DESP17661 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DESP17661 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DESP17661 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DESP17661 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DESP17661 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DESP17661 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DESP17661 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DESP17661 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DESP17661 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DESP17661 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
DESP17661 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DESP17661 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DESP17661 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DESP17661 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
DESP17661 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DESP17661 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
DESP17661 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DESP17661 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DESP17661 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DESP17661 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DESP17661 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DESP17661 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DESP17661 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DESP17661 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
DESP17661 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DESP17661 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DESP17661 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DESP17661 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
DESP17661 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
DESP17661 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DESP17661 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DESP17661 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DESP17661 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DESP17661 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DESP17661 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DESP17661 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DESP17661 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DESP17661 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DESP17661 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DESP17661 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DESP17661 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DESP17661 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DESP17661 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DESP17661 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DESP17661 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DESP17661 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms