Protein–RNA interactions for Protein: P17540

CKMT2, Creatine kinase S-type, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKMT2P17540 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CKMT2P17540 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CKMT2P17540 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CKMT2P17540 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms