Protein–RNA interactions for Protein: P17252

PRKCA, Protein kinase C alpha type, humanhuman

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCAP17252 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRKCAP17252 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRKCAP17252 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms