Protein–RNA interactions for Protein: P16333

NCK1, Cytoplasmic protein NCK1, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCK1P16333 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCK1P16333 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCK1P16333 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCK1P16333 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCK1P16333 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NCK1P16333 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCK1P16333 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCK1P16333 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCK1P16333 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCK1P16333 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NCK1P16333 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCK1P16333 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCK1P16333 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCK1P16333 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCK1P16333 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCK1P16333 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCK1P16333 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCK1P16333 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCK1P16333 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NCK1P16333 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCK1P16333 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCK1P16333 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCK1P16333 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCK1P16333 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCK1P16333 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCK1P16333 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCK1P16333 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NCK1P16333 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCK1P16333 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCK1P16333 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NCK1P16333 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NCK1P16333 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCK1P16333 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCK1P16333 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCK1P16333 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
NCK1P16333 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCK1P16333 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NCK1P16333 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NCK1P16333 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCK1P16333 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCK1P16333 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCK1P16333 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCK1P16333 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCK1P16333 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCK1P16333 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCK1P16333 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCK1P16333 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCK1P16333 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCK1P16333 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCK1P16333 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCK1P16333 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCK1P16333 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCK1P16333 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCK1P16333 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCK1P16333 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCK1P16333 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCK1P16333 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCK1P16333 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCK1P16333 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
NCK1P16333 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCK1P16333 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCK1P16333 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCK1P16333 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCK1P16333 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCK1P16333 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCK1P16333 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCK1P16333 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCK1P16333 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
NCK1P16333 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
NCK1P16333 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCK1P16333 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCK1P16333 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCK1P16333 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NCK1P16333 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NCK1P16333 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
NCK1P16333 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms