Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXB3P14651 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
HOXB3P14651 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
HOXB3P14651 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms