Protein–RNA interactions for Protein: P14543

NID1, Nidogen-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NID1P14543 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NID1P14543 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NID1P14543 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NID1P14543 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
NID1P14543 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NID1P14543 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NID1P14543 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NID1P14543 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NID1P14543 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NID1P14543 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NID1P14543 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NID1P14543 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NID1P14543 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NID1P14543 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NID1P14543 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NID1P14543 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NID1P14543 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NID1P14543 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NID1P14543 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NID1P14543 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NID1P14543 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NID1P14543 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NID1P14543 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NID1P14543 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NID1P14543 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NID1P14543 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NID1P14543 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NID1P14543 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms