Protein–RNA interactions for Protein: P13349

MYF5, Myogenic factor 5, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF5P13349 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF5P13349 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MYF5P13349 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYF5P13349 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYF5P13349 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYF5P13349 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MYF5P13349 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MYF5P13349 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF5P13349 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF5P13349 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF5P13349 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF5P13349 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF5P13349 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF5P13349 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF5P13349 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MYF5P13349 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MYF5P13349 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYF5P13349 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYF5P13349 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
MYF5P13349 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYF5P13349 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MYF5P13349 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MYF5P13349 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF5P13349 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF5P13349 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF5P13349 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF5P13349 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF5P13349 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF5P13349 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MYF5P13349 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF5P13349 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF5P13349 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF5P13349 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF5P13349 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF5P13349 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MYF5P13349 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYF5P13349 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYF5P13349 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYF5P13349 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYF5P13349 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYF5P13349 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MYF5P13349 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYF5P13349 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYF5P13349 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MYF5P13349 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF5P13349 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF5P13349 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF5P13349 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF5P13349 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF5P13349 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF5P13349 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
MYF5P13349 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF5P13349 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF5P13349 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF5P13349 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF5P13349 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF5P13349 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF5P13349 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF5P13349 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
MYF5P13349 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MYF5P13349 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
MYF5P13349 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF5P13349 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF5P13349 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF5P13349 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MYF5P13349 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF5P13349 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF5P13349 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF5P13349 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MYF5P13349 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.4 ms