Protein–RNA interactions for Protein: P13236

CCL4, C-C motif chemokine 4, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL4P13236 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4P13236 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4P13236 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4P13236 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4P13236 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4P13236 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4P13236 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4P13236 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CCL4P13236 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4P13236 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4P13236 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4P13236 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4P13236 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4P13236 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4P13236 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CCL4P13236 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
CCL4P13236 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4P13236 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4P13236 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4P13236 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CCL4P13236 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4P13236 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4P13236 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4P13236 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4P13236 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4P13236 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4P13236 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4P13236 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CCL4P13236 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4P13236 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4P13236 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4P13236 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4P13236 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4P13236 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CCL4P13236 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4P13236 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4P13236 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4P13236 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4P13236 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4P13236 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CCL4P13236 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4P13236 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4P13236 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4P13236 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4P13236 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4P13236 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4P13236 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4P13236 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4P13236 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CCL4P13236 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CCL4P13236 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4P13236 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4P13236 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4P13236 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4P13236 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4P13236 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CCL4P13236 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4P13236 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4P13236 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4P13236 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4P13236 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4P13236 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4P13236 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCL4P13236 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCL4P13236 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4P13236 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4P13236 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4P13236 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4P13236 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4P13236 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4P13236 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4P13236 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCL4P13236 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4P13236 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4P13236 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4P13236 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4P13236 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4P13236 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4P13236 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCL4P13236 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms