Protein–RNA interactions for Protein: P13073

COX4I1, Cytochrome c oxidase subunit 4 isoform 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX4I1P13073 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
COX4I1P13073 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
COX4I1P13073 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
COX4I1P13073 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms