Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CDH1P12830 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CDH1P12830 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CDH1P12830 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH1P12830 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH1P12830 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH1P12830 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH1P12830 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CDH1P12830 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH1P12830 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH1P12830 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH1P12830 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH1P12830 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH1P12830 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CDH1P12830 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH1P12830 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH1P12830 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH1P12830 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH1P12830 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH1P12830 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH1P12830 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH1P12830 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH1P12830 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH1P12830 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH1P12830 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH1P12830 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH1P12830 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH1P12830 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH1P12830 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CDH1P12830 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CDH1P12830 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH1P12830 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH1P12830 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH1P12830 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH1P12830 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH1P12830 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH1P12830 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH1P12830 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CDH1P12830 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CDH1P12830 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CDH1P12830 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms