Protein–RNA interactions for Protein: P12110

COL6A2, Collagen alpha-2(VI) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,019 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL6A2P12110 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
COL6A2P12110 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
COL6A2P12110 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
COL6A2P12110 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms