Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF1P10914 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF1P10914 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF1P10914 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
IRF1P10914 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF1P10914 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF1P10914 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF1P10914 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF1P10914 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF1P10914 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
IRF1P10914 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF1P10914 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF1P10914 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF1P10914 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF1P10914 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF1P10914 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF1P10914 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF1P10914 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF1P10914 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
IRF1P10914 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF1P10914 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF1P10914 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF1P10914 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF1P10914 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF1P10914 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF1P10914 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF1P10914 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF1P10914 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
IRF1P10914 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
IRF1P10914 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF1P10914 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
IRF1P10914 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF1P10914 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF1P10914 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF1P10914 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF1P10914 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF1P10914 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF1P10914 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF1P10914 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
IRF1P10914 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF1P10914 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF1P10914 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IRF1P10914 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF1P10914 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF1P10914 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF1P10914 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF1P10914 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF1P10914 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IRF1P10914 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF1P10914 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF1P10914 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF1P10914 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF1P10914 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF1P10914 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF1P10914 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IRF1P10914 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF1P10914 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF1P10914 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF1P10914 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF1P10914 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF1P10914 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF1P10914 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF1P10914 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IRF1P10914 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF1P10914 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF1P10914 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF1P10914 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF1P10914 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF1P10914 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF1P10914 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IRF1P10914 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IRF1P10914 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF1P10914 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF1P10914 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF1P10914 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF1P10914 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF1P10914 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF1P10914 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF1P10914 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
IRF1P10914 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF1P10914 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF1P10914 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF1P10914 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF1P10914 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF1P10914 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF1P10914 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF1P10914 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
IRF1P10914 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF1P10914 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
IRF1P10914 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms