Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
HSPD1P10809 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
HSPD1P10809 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
HSPD1P10809 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSPD1P10809 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSPD1P10809 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
HSPD1P10809 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms