Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CCDC192P0DO97 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCDC192P0DO97 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
CCDC192P0DO97 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCDC192P0DO97 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms