Protein–RNA interactions for Protein: P0DMU3

FAM231A/C-like protein LOC102723383, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P0DMU3 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P0DMU3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P0DMU3 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P0DMU3 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P0DMU3 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
P0DMU3 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P0DMU3 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P0DMU3 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
P0DMU3 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P0DMU3 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
P0DMU3 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
P0DMU3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
P0DMU3 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
P0DMU3 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P0DMU3 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P0DMU3 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
P0DMU3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
P0DMU3 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
P0DMU3 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P0DMU3 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P0DMU3 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
P0DMU3 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P0DMU3 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P0DMU3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
P0DMU3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P0DMU3 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
P0DMU3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P0DMU3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P0DMU3 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
P0DMU3 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P0DMU3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P0DMU3 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P0DMU3 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
P0DMU3 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
P0DMU3 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P0DMU3 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
P0DMU3 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P0DMU3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
P0DMU3 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms