Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
RGPD2P0DJD1 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC31.34■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.61
RGPD2P0DJD1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
RGPD2P0DJD1 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
RGPD2P0DJD1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms