Protein–RNA interactions for Protein: P0CF97

FAM200B, Protein FAM200B, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM200BP0CF97 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
FAM200BP0CF97 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FAM200BP0CF97 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FAM200BP0CF97 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms