Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FAM228BP0C875 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FAM228BP0C875 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
FAM228BP0C875 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
FAM228BP0C875 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms