Protein–RNA interactions for Protein: P08579

SNRPB2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPB2P08579 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SNRPB2P08579 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SNRPB2P08579 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms