Protein–RNA interactions for Protein: P07359

GP1BA, Platelet glycoprotein Ib alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BAP07359 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
GP1BAP07359 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GP1BAP07359 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GP1BAP07359 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms