Protein–RNA interactions for Protein: P05107

ITGB2, Integrin beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB2P05107 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ITGB2P05107 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ITGB2P05107 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ITGB2P05107 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms