Protein–RNA interactions for Protein: P03956

MMP1, Interstitial collagenase, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP1P03956 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP1P03956 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP1P03956 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MMP1P03956 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MMP1P03956 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP1P03956 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP1P03956 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP1P03956 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP1P03956 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP1P03956 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MMP1P03956 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MMP1P03956 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MMP1P03956 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP1P03956 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP1P03956 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP1P03956 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP1P03956 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP1P03956 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MMP1P03956 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MMP1P03956 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP1P03956 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP1P03956 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP1P03956 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP1P03956 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP1P03956 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP1P03956 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP1P03956 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MMP1P03956 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP1P03956 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP1P03956 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MMP1P03956 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
MMP1P03956 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MMP1P03956 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP1P03956 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP1P03956 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP1P03956 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP1P03956 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP1P03956 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP1P03956 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP1P03956 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP1P03956 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MMP1P03956 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP1P03956 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP1P03956 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP1P03956 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP1P03956 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP1P03956 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MMP1P03956 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP1P03956 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP1P03956 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP1P03956 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP1P03956 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MMP1P03956 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MMP1P03956 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MMP1P03956 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MMP1P03956 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP1P03956 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP1P03956 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP1P03956 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP1P03956 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP1P03956 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP1P03956 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP1P03956 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MMP1P03956 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP1P03956 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP1P03956 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP1P03956 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP1P03956 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP1P03956 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MMP1P03956 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms