Protein–RNA interactions for Protein: P01903

HLA-DRA, HLA class II histocompatibility antigen, DR alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DRAP01903 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
HLA-DRAP01903 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
HLA-DRAP01903 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
HLA-DRAP01903 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.1 ms