Protein–RNA interactions for Protein: P01893

HLA-H, Putative HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain H, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-HP01893 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-HP01893 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-HP01893 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-HP01893 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms