Protein–RNA interactions for Protein: O95704

APBB3, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBB3O95704 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBB3O95704 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBB3O95704 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBB3O95704 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBB3O95704 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBB3O95704 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
APBB3O95704 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBB3O95704 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBB3O95704 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
APBB3O95704 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBB3O95704 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBB3O95704 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
APBB3O95704 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
APBB3O95704 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBB3O95704 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBB3O95704 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBB3O95704 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBB3O95704 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
APBB3O95704 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBB3O95704 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBB3O95704 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
APBB3O95704 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBB3O95704 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
APBB3O95704 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBB3O95704 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBB3O95704 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBB3O95704 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBB3O95704 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBB3O95704 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBB3O95704 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBB3O95704 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBB3O95704 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
APBB3O95704 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBB3O95704 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APBB3O95704 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBB3O95704 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBB3O95704 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBB3O95704 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBB3O95704 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APBB3O95704 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APBB3O95704 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBB3O95704 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APBB3O95704 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APBB3O95704 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APBB3O95704 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APBB3O95704 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBB3O95704 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBB3O95704 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBB3O95704 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APBB3O95704 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBB3O95704 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBB3O95704 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBB3O95704 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APBB3O95704 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBB3O95704 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBB3O95704 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBB3O95704 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APBB3O95704 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APBB3O95704 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APBB3O95704 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBB3O95704 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBB3O95704 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBB3O95704 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBB3O95704 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBB3O95704 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APBB3O95704 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBB3O95704 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBB3O95704 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APBB3O95704 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms