Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
POLR1AO95602 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC34.52■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
POLR1AO95602 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.46■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.45■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
POLR1AO95602 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC34.44■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.44■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.42■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
POLR1AO95602 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms