Protein–RNA interactions for Protein: O95409

ZIC2, Zinc finger protein ZIC 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC2O95409 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ZIC2O95409 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ZIC2O95409 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ZIC2O95409 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms